Ontólogo Sénior, Descubrimiento de Biológicos

• Título avanzado en Informática Biomédica, Biología Computacional, Bioinformática, Ciencia de Datos, Ciencias de la Computación o un campo relacionado.
• Más de 3 años en ingeniería de ontologías, modelado de conocimiento, diseño de taxonomías, estándares semánticos o desarrollo de grafos de conocimiento.
• Experiencia práctica con flujos de trabajo de versionado, gestión de cambios, validación y lanzamiento de activos de ontología.
• Competencia en OWL, RDF(S), SKOS, SHACL, SPARQL y patrones de diseño de ontologías.
• Experiencia con tecnologías de grafos/semánticas (por ejemplo, Neo4j, GraphDB, Amazon Neptune, Stardog, Protégé, almacenes de triples RDF).
• Capacidad para traducir discusiones científicas en modelos semánticos, pruebas de validación y planes de entrega, y para alinear la semántica entre equipos y organizaciones asociadas.
• Fuertes habilidades de comunicación y colaboración transversal en un entorno de I+D matricial.
• Conocimiento práctico de cómo las ontologías y los grafos de conocimiento fundamentan la IA y la recuperación agéntica (por ejemplo, búsqueda semántica, RAG o enfoques GraphRAG).

Preferible

• Experiencia en biológicos, diseño de anticuerpos, ingeniería de proteínas, biología de ensayos o experimentación de alto rendimiento.
• Experiencia operando en un entorno empresarial gobernado, preferiblemente farmacéutico o biotecnológico, aplicando los principios de datos FAIR y permitiendo la interoperabilidad en los traspasos de investigación y desarrollo.
• Experiencia integrando activos de ontología en pipelines de datos, grafos de conocimiento, búsqueda o herramientas de IA agéntica / GraphRAG.
• Familiaridad con las ontologías de OBO Foundry, UMLS, GO, ChEBI, UniProt, HL7/FHIR o CDISC.

Advanced Analytics, Business Intelligence (BI), Coaching, Collaboration, Critical Thinking, Data Analysis, Database Management, Data Privacy Standards, Data Reporting, Data Savvy, Data Science, Data Visualization, Econometric Models, Process Improvements, Technical Credibility, Technologically Savvy, Workflow Analysis

55.400,00 € - 87.860,00 €

Además del salario base, ofrecemos los siguientes beneficios*: un bono anual con un objetivo establecido (% del salario) dependiendo del nivel salarial / ubicación, donde el importe real se basa en el rendimiento de los empleados y de la empresa del año natural anterior, o comisiones por ventas. Además, ofrecemos días de vacaciones, permiso parental por un mínimo de 12 semanas, permiso por duelo, permiso para cuidadores, permiso de voluntariado, reembolso de bienestar y programas para la salud financiera, física y mental. También ofrecemos premios por aniversario de servicio y reconocimiento y, sujeto a los términos de sus respectivos planes, los empleados —y en algunas ubicaciones, sus dependientes elegibles— pueden participar en varios planes de seguros. Para más información, visite Employee benefits | Supporting well-being & career growth | Johnson & Johnson Careers.

*Esto es solo para fines informativos. Los importes y los beneficios reales pueden variar según la ubicación y están sujetos a cambios.

Nuestra experiencia en Innovative Medicine se nutre e inspira en los pacientes, cuyos conocimientos impulsan nuestros avances basados en la ciencia. Visionarios como tú trabajan en equipos que salvan vidas desarrollando las medicinas del mañana.

Únete a nosotros para desarrollar tratamientos, encontrar curas y liderar el camino del laboratorio a la vida, defendiendo a los pacientes en cada paso del camino.

Más información en https://www.jnj.com/innovative-medicine

Johnson & Johnson Innovative Medicine busca un Senior Ontologist dedicado a nuestra organización de Biologics Discovery. Este es un rol horizontal y transversal que es propietario de la base semántica que afecta a cada conjunto de datos y a cada equipo: cómo se conectan, gobiernan, descubren y reutilizan los datos de anticuerpos, ingeniería de proteínas, ensayos, automatización, secuencias, socios externos y la cartera de descubrimiento. Serás un ontólogo práctico y un catalizador interfuncional, transformando el complejo lenguaje científico en ontologías reutilizables, vocabularios controlados, mapeos y estándares semánticos.

Por qué es importante este rol:
Los datos de Biologics se generan en muchos sistemas y equipos, a menudo con una terminología que difiere según la fuente, lo que limita la capacidad de científicos y modelos para encontrarlos, compararlos y reutilizarlos. Este rol proporciona el tejido conectivo semántico que hace que esos datos sean computables, interoperables y estén listos para la IA en toda la cartera de Discovery y con los socios de CMC, alineándose con los estándares de la empresa en lugar de reinventarlos, para que la semántica siga siendo duradera a medida que las plataformas evolucionan.

Como Senior Ontologist para Biologics Discovery, diseñarás, construirás, probarás, publicarás y gobernarás modelos semánticos que permitan grafos de conocimiento, productos de datos, búsqueda, análisis e IA/ML en los flujos de trabajo de biológicos. Colaborarás con científicos experimentales, biólogos computacionales, científicos de datos, ingenieros de datos, equipos de plataforma e IT para capturar la semántica del dominio y traducirla en módulos de ontología bien estructurados, y establecerás los estándares semánticos adoptados en los productos de datos del equipo.

Un propósito central de este trabajo es hacer que nuestros datos estén listos para agentes: los sistemas de IA agéntica no pueden navegar, interpretar o actuar de forma fiable sobre datos científicos sin los vocabularios, relaciones y restricciones compartidos que proporcionan las ontologías. Construirás la capa semántica que permita a los agentes fundamentar su razonamiento, recuperar los datos correctos y conectar la evidencia a través de experimentos, convirtiendo los datos fragmentados en conocimiento sobre el que tanto los científicos como la IA puedan actuar.

Alinearás la semántica de los biológicos con nuestros estándares semánticos y de gobernanza empresariales, y colaborarás con ontólogos pares que apoyan a Chemistry, Manufacturing, and Controls (CMC) en la organización de Therapeutics Development & Supply, para que la semántica de Discovery y la de las etapas posteriores se mantengan alineadas a lo largo del ciclo de vida de la molécula.

Perfil del Candidato Ideal

El candidato ideal es un constructor, traductor y pensador de sistemas con conocimientos sobre el descubrimiento de biológicos y motivado por su potencial para impactar en la salud humana. Puede discutir la ciencia con fluidez con los equipos experimentales, diseñar modelos semánticos rigurosos con pares técnicos, traducir la biología compleja en formatos legibles por máquina, representar a Discovery de forma creíble ante socios empresariales y de desarrollo, y abogar por una gobernanza que haga que los datos sean más reutilizables sin frenar la innovación. Le motiva, por encima de todo, convertir el conocimiento conectado de biológicos en medicinas más rápidas y mejores para los pacientes.

Análisis de datos y ciencias computacionales

Ciencia de datos

• Modelar, codificar, probar y lanzar módulos de ontología validados y con versiones, vocabularios controlados y mapeos en los dominios de descubrimiento de biológicos, incluyendo ingeniería de anticuerpos y proteínas, metadatos de ensayos, diseño molecular, perfilado, resultados de automatización, conocimiento de secuencias/constructos y señales de desarrollabilidad.
• Publicar paquetes de ontologías como activos semánticos listos para API que puedan ser consumidos por grafos de conocimiento, productos de datos y flujos de trabajo de IA/ML.
• Colaborar estrechamente con biólogos, científicos de ensayos, equipos de automatización y otros expertos en la materia para extraer, refinar y traducir conceptos científicos complejos en modelos semánticos computables, equilibrando la precisión científica con la utilidad y adopción práctica.
• Expresar conceptos científicos y operativos como clases y propiedades OWL/RDF, vocabularios SKOS, restricciones SHACL y patrones de diseño reutilizables, y establecer los estándares semánticos adoptados en los productos de datos del equipo.

Grafos de Conocimiento e Integración Semántica

• Colaborar con ingenieros de datos para integrar capas semánticas en pipelines de datos, catálogos y plataformas de grafos de conocimiento.
• Modelar no solo entidades y conceptos científicos, sino también los procesos, flujos de trabajo, actividades experimentales y puntos de decisión que generan y gobiernan esas entidades, proporcionando el contexto necesario para la interoperabilidad, la procedencia y la reutilización.
• Permitir la vinculación de entidades, clasificación, normalización, captura de procedencia y búsqueda semántica en conjuntos de datos de biológicos, y fundamentar la IA agéntica y los flujos de trabajo de recuperación (por ejemplo, enfoques de grafos de conocimiento y GraphRAG) para que los agentes puedan navegar, interpretar y actuar de forma fiable sobre los datos científicos.
• Construir y mantener consultas semánticas (por ejemplo, SPARQL) y validaciones automatizadas que midan la cobertura semántica, la conformidad, el linaje y la integridad.

Alineación Empresarial y Transversal

• Responsabilizarse de la alineación semántica con la gobernanza de datos empresarial y los estándares de grafos de conocimiento, para que Biologics Discovery se construya sobre activos empresariales compartidos en lugar de duplicar la gobernanza.
• Armonizar la terminología y los modelos con ontólogos pares que apoyan el desarrollo posterior (CMC) en los datos de procesos, fabricación, calidad y ciclo de vida del producto, asegurando que los traspasos de descubrimiento a desarrollo sigan siendo trazables e interoperables.
• Impulsar el consenso entre los equipos científicos, de informática y de datos sobre el alcance, las definiciones y la adopción de la ontología, representando las necesidades semánticas de Discovery en los foros empresariales.
• Aplicar directrices de modelado, convenciones de nomenclatura y versionado, gestión de cambios, reglas de depreciación y controles de calidad semántica alineados con la gobernanza empresarial.

Por qué este rol es único

Esta es una oportunidad poco común para definir la base semántica de Biologics Discovery y trabajar en una de sus interfaces interorganizacionales más estratégicas: la alineación con la gobernanza de datos empresarial y los socios de desarrollo posterior. Darás forma a cómo se captura, conecta, gobierna y se hace accionable el conocimiento de biológicos revolucionarios para los científicos y los sistemas de IA.

Madrid, España

Este puesto tendrá su base en una de nuestras ubicaciones de oficina en Spring House, PA (muy preferible), Titusville, NJ, o Raritan, NJ, EE. UU.; Beerse, BE, o Madrid, España. (Sin opción de teletrabajo).

Este puesto tendrá su base en una de nuestras ubicaciones de oficina en Spring House, PA (muy preferible), Titusville, NJ, o Raritan, NJ, EE. UU.; Beerse, BE, o Madrid, España. (Sin opción de teletrabajo).

Científico/Tecnológico

Ten en cuenta que este puesto está disponible en varios países y puede publicarse con diferentes números de solicitud para cumplir con los requisitos locales. Aunque puedes solicitar cualquiera o todas las publicaciones, te recomendamos centrarte en el país o países específicos que coincidan con tus ubicaciones preferidas:

EE. UU. - Número de solicitud: R-099961

España - Número de solicitud: R-100659

Bélgica - Número de solicitud: R-100662